Organische Dünger bestehen aus pflanzlichen-, die industriell hergestellten auch aus tierischen Substanzen. Sie enthalten häufig auch natürliche, mineralische Zusätze. Organische Dünger wirken langfristig und nachhaltig, da sie das Bodenleben fördern und dadurch zu einem gesunden Gartenboden beitragen. Die enthaltenen Nährstoffe werden erst durch Bodenorganismen für die Pflanzen verfügbar gemacht.
Organische Dünger kann man gut selbst herstellen (z.B. Kompost, Pflanzenjauchen, Bokashi). Falls man den Dünger lieber kauft, sollte die Auswahl auf Produkte fallen, die für den ökologischen Anbau zugelassen sind.